Afty mogą dotknąć osoby w każdym wieku i mogą być spowodowane przez różne schorzenia. Chociaż przyczyny nie są w pełni zrozumiałe, pojawienie się aft jest związane z zaburzeniami równowagi układu odpornościowego i czynnikami dziedzicznymi. Pojawienie się aft może być związane z jednym z następujących 6 schorzeń.

1. Jedną z najczęstszych przyczyn powstawania aft jest ta związana z układem odpornościowym . Jeśli jest osłabiony, siły obronne są obniżone, a organizm nie jest w stanie skutecznie zwalczać bakterii, które dostają się do organizmu i niszczą część tkanek w jamie ustnej.
2. Nawet stres czynnikiem wyzwalającym afty. Oprócz wpływu na układ odpornościowy, stres wysusza usta, zwiększając ryzyko wystąpienia zmian.
3. Stosowanie niektórych leków może powodować owrzodzenia jamy ustnej.